Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prr27Q3SYJ2 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms