Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms