Protein–RNA interactions for Protein: Q32KG4

Rtl9, Retrotransposon Gag-like protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rtl9Q32KG4 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rtl9Q32KG4 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rtl9Q32KG4 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rtl9Q32KG4 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rtl9Q32KG4 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rtl9Q32KG4 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rtl9Q32KG4 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rtl9Q32KG4 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rtl9Q32KG4 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rtl9Q32KG4 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rtl9Q32KG4 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rtl9Q32KG4 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rtl9Q32KG4 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rtl9Q32KG4 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Rtl9Q32KG4 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rtl9Q32KG4 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rtl9Q32KG4 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Rtl9Q32KG4 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rtl9Q32KG4 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Rtl9Q32KG4 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Rtl9Q32KG4 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Rtl9Q32KG4 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rtl9Q32KG4 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rtl9Q32KG4 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rtl9Q32KG4 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rtl9Q32KG4 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rtl9Q32KG4 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rtl9Q32KG4 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Rtl9Q32KG4 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Rtl9Q32KG4 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Rtl9Q32KG4 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rtl9Q32KG4 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rtl9Q32KG4 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rtl9Q32KG4 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rtl9Q32KG4 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rtl9Q32KG4 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Rtl9Q32KG4 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Rtl9Q32KG4 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rtl9Q32KG4 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Rtl9Q32KG4 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Rtl9Q32KG4 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rtl9Q32KG4 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rtl9Q32KG4 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rtl9Q32KG4 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rtl9Q32KG4 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rtl9Q32KG4 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Rtl9Q32KG4 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rtl9Q32KG4 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rtl9Q32KG4 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rtl9Q32KG4 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rtl9Q32KG4 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rtl9Q32KG4 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rtl9Q32KG4 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rtl9Q32KG4 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rtl9Q32KG4 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rtl9Q32KG4 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rtl9Q32KG4 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rtl9Q32KG4 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rtl9Q32KG4 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rtl9Q32KG4 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rtl9Q32KG4 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rtl9Q32KG4 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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