Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
ptchd1Q14B62 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
ptchd1Q14B62 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
ptchd1Q14B62 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
ptchd1Q14B62 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ptchd1Q14B62 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ptchd1Q14B62 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
ptchd1Q14B62 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ptchd1Q14B62 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ptchd1Q14B62 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ptchd1Q14B62 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ptchd1Q14B62 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ptchd1Q14B62 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ptchd1Q14B62 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
ptchd1Q14B62 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
ptchd1Q14B62 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ptchd1Q14B62 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ptchd1Q14B62 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ptchd1Q14B62 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ptchd1Q14B62 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ptchd1Q14B62 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ptchd1Q14B62 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
ptchd1Q14B62 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
ptchd1Q14B62 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ptchd1Q14B62 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ptchd1Q14B62 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ptchd1Q14B62 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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ptchd1Q14B62 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
ptchd1Q14B62 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ptchd1Q14B62 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ptchd1Q14B62 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ptchd1Q14B62 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ptchd1Q14B62 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ptchd1Q14B62 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ptchd1Q14B62 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ptchd1Q14B62 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ptchd1Q14B62 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ptchd1Q14B62 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ptchd1Q14B62 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ptchd1Q14B62 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ptchd1Q14B62 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ptchd1Q14B62 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ptchd1Q14B62 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ptchd1Q14B62 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ptchd1Q14B62 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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ptchd1Q14B62 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ptchd1Q14B62 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ptchd1Q14B62 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ptchd1Q14B62 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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ptchd1Q14B62 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ptchd1Q14B62 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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ptchd1Q14B62 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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ptchd1Q14B62 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
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ptchd1Q14B62 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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ptchd1Q14B62 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ptchd1Q14B62 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ptchd1Q14B62 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ptchd1Q14B62 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ptchd1Q14B62 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ptchd1Q14B62 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ptchd1Q14B62 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
ptchd1Q14B62 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ptchd1Q14B62 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ptchd1Q14B62 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ptchd1Q14B62 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ptchd1Q14B62 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ptchd1Q14B62 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ptchd1Q14B62 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ptchd1Q14B62 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ptchd1Q14B62 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
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ptchd1Q14B62 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ptchd1Q14B62 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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