Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF2

Tmem52b, Transmembrane protein 52B, mousemouse

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Length 186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem52bQ0VBF2 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem52bQ0VBF2 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem52bQ0VBF2 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem52bQ0VBF2 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem52bQ0VBF2 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem52bQ0VBF2 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem52bQ0VBF2 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem52bQ0VBF2 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem52bQ0VBF2 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem52bQ0VBF2 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem52bQ0VBF2 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem52bQ0VBF2 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem52bQ0VBF2 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem52bQ0VBF2 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem52bQ0VBF2 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem52bQ0VBF2 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem52bQ0VBF2 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem52bQ0VBF2 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem52bQ0VBF2 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem52bQ0VBF2 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem52bQ0VBF2 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem52bQ0VBF2 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem52bQ0VBF2 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem52bQ0VBF2 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem52bQ0VBF2 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem52bQ0VBF2 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem52bQ0VBF2 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem52bQ0VBF2 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem52bQ0VBF2 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem52bQ0VBF2 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem52bQ0VBF2 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem52bQ0VBF2 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem52bQ0VBF2 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem52bQ0VBF2 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem52bQ0VBF2 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem52bQ0VBF2 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem52bQ0VBF2 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem52bQ0VBF2 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem52bQ0VBF2 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem52bQ0VBF2 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem52bQ0VBF2 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem52bQ0VBF2 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem52bQ0VBF2 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem52bQ0VBF2 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem52bQ0VBF2 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem52bQ0VBF2 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem52bQ0VBF2 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem52bQ0VBF2 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem52bQ0VBF2 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem52bQ0VBF2 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem52bQ0VBF2 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem52bQ0VBF2 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem52bQ0VBF2 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem52bQ0VBF2 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem52bQ0VBF2 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem52bQ0VBF2 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem52bQ0VBF2 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem52bQ0VBF2 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem52bQ0VBF2 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem52bQ0VBF2 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem52bQ0VBF2 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem52bQ0VBF2 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem52bQ0VBF2 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem52bQ0VBF2 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem52bQ0VBF2 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem52bQ0VBF2 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem52bQ0VBF2 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem52bQ0VBF2 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem52bQ0VBF2 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem52bQ0VBF2 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem52bQ0VBF2 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem52bQ0VBF2 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem52bQ0VBF2 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem52bQ0VBF2 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem52bQ0VBF2 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem52bQ0VBF2 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem52bQ0VBF2 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem52bQ0VBF2 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem52bQ0VBF2 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem52bQ0VBF2 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem52bQ0VBF2 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem52bQ0VBF2 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem52bQ0VBF2 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem52bQ0VBF2 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem52bQ0VBF2 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem52bQ0VBF2 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem52bQ0VBF2 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem52bQ0VBF2 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem52bQ0VBF2 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem52bQ0VBF2 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmem52bQ0VBF2 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmem52bQ0VBF2 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmem52bQ0VBF2 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmem52bQ0VBF2 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmem52bQ0VBF2 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmem52bQ0VBF2 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmem52bQ0VBF2 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmem52bQ0VBF2 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmem52bQ0VBF2 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmem52bQ0VBF2 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
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