Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubxn2bQ0KL01 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubxn2bQ0KL01 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubxn2bQ0KL01 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubxn2bQ0KL01 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubxn2bQ0KL01 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubxn2bQ0KL01 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubxn2bQ0KL01 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubxn2bQ0KL01 Tprkb-204ENSMUST00000113752 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubxn2bQ0KL01 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubxn2bQ0KL01 Nnmt-202ENSMUST00000119426 912 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubxn2bQ0KL01 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubxn2bQ0KL01 Gm14993-201ENSMUST00000121180 164 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubxn2bQ0KL01 Gm15620-201ENSMUST00000122949 270 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubxn2bQ0KL01 Slfn5os-201ENSMUST00000127074 574 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubxn2bQ0KL01 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubxn2bQ0KL01 Prr33-202ENSMUST00000151580 399 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubxn2bQ0KL01 Gm16240-201ENSMUST00000161924 614 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubxn2bQ0KL01 Gm45085-201ENSMUST00000209100 441 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubxn2bQ0KL01 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubxn2bQ0KL01 Gm45542-201ENSMUST00000210456 438 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubxn2bQ0KL01 Gm20735-202ENSMUST00000212387 519 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubxn2bQ0KL01 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubxn2bQ0KL01 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubxn2bQ0KL01 Mir326-201ENSMUST00000083637 95 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubxn2bQ0KL01 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubxn2bQ0KL01 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubxn2bQ0KL01 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubxn2bQ0KL01 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubxn2bQ0KL01 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubxn2bQ0KL01 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubxn2bQ0KL01 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubxn2bQ0KL01 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubxn2bQ0KL01 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubxn2bQ0KL01 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubxn2bQ0KL01 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubxn2bQ0KL01 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubxn2bQ0KL01 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubxn2bQ0KL01 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubxn2bQ0KL01 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubxn2bQ0KL01 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubxn2bQ0KL01 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubxn2bQ0KL01 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubxn2bQ0KL01 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubxn2bQ0KL01 Gm13204-201ENSMUST00000120110 821 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubxn2bQ0KL01 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubxn2bQ0KL01 Gm11884-201ENSMUST00000131639 641 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubxn2bQ0KL01 Gm12906-201ENSMUST00000154610 441 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubxn2bQ0KL01 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubxn2bQ0KL01 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubxn2bQ0KL01 Prss51-204ENSMUST00000224112 1042 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubxn2bQ0KL01 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubxn2bQ0KL01 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubxn2bQ0KL01 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubxn2bQ0KL01 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubxn2bQ0KL01 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubxn2bQ0KL01 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubxn2bQ0KL01 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubxn2bQ0KL01 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubxn2bQ0KL01 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubxn2bQ0KL01 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubxn2bQ0KL01 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubxn2bQ0KL01 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubxn2bQ0KL01 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubxn2bQ0KL01 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubxn2bQ0KL01 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubxn2bQ0KL01 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubxn2bQ0KL01 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubxn2bQ0KL01 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubxn2bQ0KL01 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubxn2bQ0KL01 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubxn2bQ0KL01 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubxn2bQ0KL01 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubxn2bQ0KL01 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubxn2bQ0KL01 Gm24943-201ENSMUST00000158329 433 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubxn2bQ0KL01 Gas5-224ENSMUST00000162558 502 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubxn2bQ0KL01 7420461P10Rik-201ENSMUST00000169439 781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubxn2bQ0KL01 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubxn2bQ0KL01 Gm29135-201ENSMUST00000188411 612 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubxn2bQ0KL01 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubxn2bQ0KL01 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubxn2bQ0KL01 Gm39397-201ENSMUST00000212331 228 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubxn2bQ0KL01 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubxn2bQ0KL01 CT030652.1-201ENSMUST00000227377 1235 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubxn2bQ0KL01 Uqcrc2-201ENSMUST00000033176 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubxn2bQ0KL01 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubxn2bQ0KL01 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubxn2bQ0KL01 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubxn2bQ0KL01 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubxn2bQ0KL01 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubxn2bQ0KL01 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubxn2bQ0KL01 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubxn2bQ0KL01 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubxn2bQ0KL01 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubxn2bQ0KL01 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubxn2bQ0KL01 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ubxn2bQ0KL01 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ubxn2bQ0KL01 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ubxn2bQ0KL01 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ubxn2bQ0KL01 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms