Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

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Length 1,315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ttc21bQ0HA38 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ttc21bQ0HA38 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ttc21bQ0HA38 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ttc21bQ0HA38 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ttc21bQ0HA38 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ttc21bQ0HA38 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ttc21bQ0HA38 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Ttc21bQ0HA38 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ttc21bQ0HA38 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ttc21bQ0HA38 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ttc21bQ0HA38 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ttc21bQ0HA38 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ttc21bQ0HA38 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ttc21bQ0HA38 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ttc21bQ0HA38 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ttc21bQ0HA38 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ttc21bQ0HA38 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ttc21bQ0HA38 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ttc21bQ0HA38 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttc21bQ0HA38 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttc21bQ0HA38 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttc21bQ0HA38 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttc21bQ0HA38 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttc21bQ0HA38 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttc21bQ0HA38 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttc21bQ0HA38 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttc21bQ0HA38 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttc21bQ0HA38 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttc21bQ0HA38 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttc21bQ0HA38 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttc21bQ0HA38 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttc21bQ0HA38 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttc21bQ0HA38 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttc21bQ0HA38 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttc21bQ0HA38 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttc21bQ0HA38 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttc21bQ0HA38 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttc21bQ0HA38 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttc21bQ0HA38 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttc21bQ0HA38 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttc21bQ0HA38 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttc21bQ0HA38 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttc21bQ0HA38 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttc21bQ0HA38 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttc21bQ0HA38 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttc21bQ0HA38 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttc21bQ0HA38 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttc21bQ0HA38 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttc21bQ0HA38 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttc21bQ0HA38 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttc21bQ0HA38 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttc21bQ0HA38 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttc21bQ0HA38 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
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Ttc21bQ0HA38 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttc21bQ0HA38 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttc21bQ0HA38 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttc21bQ0HA38 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttc21bQ0HA38 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttc21bQ0HA38 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttc21bQ0HA38 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttc21bQ0HA38 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
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Ttc21bQ0HA38 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
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Ttc21bQ0HA38 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttc21bQ0HA38 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttc21bQ0HA38 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttc21bQ0HA38 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttc21bQ0HA38 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttc21bQ0HA38 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttc21bQ0HA38 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttc21bQ0HA38 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttc21bQ0HA38 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttc21bQ0HA38 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttc21bQ0HA38 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttc21bQ0HA38 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttc21bQ0HA38 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttc21bQ0HA38 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttc21bQ0HA38 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttc21bQ0HA38 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttc21bQ0HA38 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttc21bQ0HA38 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttc21bQ0HA38 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttc21bQ0HA38 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttc21bQ0HA38 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttc21bQ0HA38 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttc21bQ0HA38 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttc21bQ0HA38 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttc21bQ0HA38 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttc21bQ0HA38 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttc21bQ0HA38 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttc21bQ0HA38 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttc21bQ0HA38 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttc21bQ0HA38 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttc21bQ0HA38 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttc21bQ0HA38 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
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