Protein–RNA interactions for Protein: Q08093

Cnn2, Calponin-2, mousemouse

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn2Q08093 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cnn2Q08093 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms