Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 Zfp626-201ENSMUST00000080175 816 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Siah2Q06986 Olfr725-201ENSMUST00000089844 1110 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Siah2Q06986 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Siah2Q06986 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Siah2Q06986 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Siah2Q06986 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Siah2Q06986 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Siah2Q06986 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Siah2Q06986 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Siah2Q06986 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Siah2Q06986 Milr1-201ENSMUST00000086353 1348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Siah2Q06986 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Siah2Q06986 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Siah2Q06986 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Siah2Q06986 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Siah2Q06986 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Siah2Q06986 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Siah2Q06986 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Siah2Q06986 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Siah2Q06986 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Siah2Q06986 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Siah2Q06986 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Siah2Q06986 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Siah2Q06986 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Siah2Q06986 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Siah2Q06986 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Siah2Q06986 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Siah2Q06986 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Siah2Q06986 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Siah2Q06986 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Siah2Q06986 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Siah2Q06986 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Siah2Q06986 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Siah2Q06986 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Siah2Q06986 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Siah2Q06986 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Siah2Q06986 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Siah2Q06986 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Siah2Q06986 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Siah2Q06986 Fam122c-203ENSMUST00000186314 898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Siah2Q06986 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Siah2Q06986 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Siah2Q06986 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Siah2Q06986 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Siah2Q06986 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Siah2Q06986 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Siah2Q06986 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Siah2Q06986 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Siah2Q06986 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Siah2Q06986 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Siah2Q06986 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Siah2Q06986 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Siah2Q06986 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Siah2Q06986 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Siah2Q06986 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Siah2Q06986 9230113P08Rik-201ENSMUST00000176049 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Siah2Q06986 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Siah2Q06986 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Siah2Q06986 Cntnap2-201ENSMUST00000060839 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Siah2Q06986 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Siah2Q06986 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Siah2Q06986 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Siah2Q06986 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Siah2Q06986 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Siah2Q06986 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Siah2Q06986 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Siah2Q06986 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Siah2Q06986 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Siah2Q06986 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Siah2Q06986 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Siah2Q06986 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Siah2Q06986 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Siah2Q06986 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Siah2Q06986 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Siah2Q06986 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Siah2Q06986 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Siah2Q06986 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Siah2Q06986 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Siah2Q06986 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Siah2Q06986 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Siah2Q06986 Gm38195-201ENSMUST00000194247 1499 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Siah2Q06986 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Siah2Q06986 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Siah2Q06986 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Siah2Q06986 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Siah2Q06986 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Siah2Q06986 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Siah2Q06986 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Siah2Q06986 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Siah2Q06986 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Siah2Q06986 Atp6v1c2-202ENSMUST00000095820 1549 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Siah2Q06986 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Siah2Q06986 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Siah2Q06986 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Siah2Q06986 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Siah2Q06986 4930440I19Rik-202ENSMUST00000145972 676 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Siah2Q06986 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Siah2Q06986 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Siah2Q06986 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Siah2Q06986 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms