Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Gm28745-201ENSMUST00000190069 305 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms