Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Kcnb1Q03717 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Kcnb1Q03717 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Kcnb1Q03717 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Kcnb1Q03717 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Kcnb1Q03717 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Kcnb1Q03717 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Kcnb1Q03717 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Kcnb1Q03717 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Kcnb1Q03717 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Kcnb1Q03717 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Kcnb1Q03717 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Kcnb1Q03717 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Kcnb1Q03717 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Kcnb1Q03717 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Kcnb1Q03717 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Kcnb1Q03717 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Kcnb1Q03717 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Kcnb1Q03717 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Kcnb1Q03717 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Kcnb1Q03717 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Kcnb1Q03717 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Kcnb1Q03717 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Kcnb1Q03717 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Kcnb1Q03717 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Kcnb1Q03717 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Kcnb1Q03717 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Kcnb1Q03717 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Kcnb1Q03717 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Kcnb1Q03717 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Kcnb1Q03717 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Kcnb1Q03717 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Kcnb1Q03717 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Kcnb1Q03717 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Kcnb1Q03717 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Kcnb1Q03717 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Kcnb1Q03717 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Kcnb1Q03717 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Kcnb1Q03717 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Kcnb1Q03717 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Kcnb1Q03717 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Kcnb1Q03717 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Kcnb1Q03717 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Kcnb1Q03717 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Kcnb1Q03717 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Kcnb1Q03717 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Kcnb1Q03717 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Kcnb1Q03717 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Kcnb1Q03717 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Kcnb1Q03717 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Kcnb1Q03717 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Kcnb1Q03717 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Kcnb1Q03717 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Kcnb1Q03717 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Kcnb1Q03717 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Kcnb1Q03717 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Kcnb1Q03717 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Kcnb1Q03717 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Kcnb1Q03717 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Kcnb1Q03717 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Kcnb1Q03717 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Kcnb1Q03717 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Kcnb1Q03717 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Kcnb1Q03717 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Kcnb1Q03717 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Kcnb1Q03717 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Kcnb1Q03717 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Kcnb1Q03717 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Kcnb1Q03717 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Kcnb1Q03717 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Kcnb1Q03717 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Kcnb1Q03717 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Kcnb1Q03717 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Kcnb1Q03717 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Kcnb1Q03717 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Kcnb1Q03717 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Kcnb1Q03717 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Kcnb1Q03717 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Kcnb1Q03717 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Kcnb1Q03717 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Kcnb1Q03717 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Kcnb1Q03717 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Kcnb1Q03717 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Kcnb1Q03717 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Kcnb1Q03717 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Kcnb1Q03717 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Kcnb1Q03717 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Kcnb1Q03717 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Kcnb1Q03717 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Kcnb1Q03717 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Kcnb1Q03717 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Kcnb1Q03717 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Kcnb1Q03717 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Kcnb1Q03717 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Kcnb1Q03717 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Kcnb1Q03717 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Kcnb1Q03717 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Kcnb1Q03717 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Kcnb1Q03717 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Kcnb1Q03717 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms