Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
GscQ02591 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
GscQ02591 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
GscQ02591 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
GscQ02591 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
GscQ02591 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
GscQ02591 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
GscQ02591 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
GscQ02591 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
GscQ02591 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
GscQ02591 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
GscQ02591 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
GscQ02591 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
GscQ02591 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
GscQ02591 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
GscQ02591 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
GscQ02591 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
GscQ02591 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
GscQ02591 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
GscQ02591 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
GscQ02591 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
GscQ02591 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
GscQ02591 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
GscQ02591 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
GscQ02591 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
GscQ02591 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
GscQ02591 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
GscQ02591 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
GscQ02591 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
GscQ02591 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
GscQ02591 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
GscQ02591 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
GscQ02591 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
GscQ02591 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
GscQ02591 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
GscQ02591 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
GscQ02591 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
GscQ02591 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
GscQ02591 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
GscQ02591 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
GscQ02591 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
GscQ02591 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
GscQ02591 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
GscQ02591 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
GscQ02591 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
GscQ02591 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
GscQ02591 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
GscQ02591 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
GscQ02591 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
GscQ02591 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
GscQ02591 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
GscQ02591 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
GscQ02591 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
GscQ02591 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
GscQ02591 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GscQ02591 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GscQ02591 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GscQ02591 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GscQ02591 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GscQ02591 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GscQ02591 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GscQ02591 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GscQ02591 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GscQ02591 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GscQ02591 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GscQ02591 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GscQ02591 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
GscQ02591 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GscQ02591 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GscQ02591 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
GscQ02591 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GscQ02591 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GscQ02591 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GscQ02591 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
GscQ02591 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GscQ02591 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GscQ02591 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GscQ02591 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GscQ02591 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GscQ02591 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GscQ02591 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GscQ02591 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GscQ02591 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GscQ02591 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GscQ02591 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GscQ02591 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GscQ02591 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GscQ02591 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GscQ02591 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GscQ02591 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GscQ02591 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GscQ02591 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
GscQ02591 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
GscQ02591 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GscQ02591 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GscQ02591 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GscQ02591 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GscQ02591 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GscQ02591 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
GscQ02591 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms