Protein–RNA interactions for Protein: Q02248

Ctnnb1, Catenin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnb1Q02248 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctnnb1Q02248 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms