Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms