Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HmgcrQ01237 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HmgcrQ01237 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HmgcrQ01237 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HmgcrQ01237 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HmgcrQ01237 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HmgcrQ01237 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HmgcrQ01237 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HmgcrQ01237 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
HmgcrQ01237 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
HmgcrQ01237 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
HmgcrQ01237 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HmgcrQ01237 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HmgcrQ01237 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HmgcrQ01237 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HmgcrQ01237 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HmgcrQ01237 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HmgcrQ01237 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HmgcrQ01237 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
HmgcrQ01237 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
HmgcrQ01237 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HmgcrQ01237 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HmgcrQ01237 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HmgcrQ01237 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
HmgcrQ01237 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HmgcrQ01237 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
HmgcrQ01237 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HmgcrQ01237 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HmgcrQ01237 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HmgcrQ01237 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HmgcrQ01237 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
HmgcrQ01237 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HmgcrQ01237 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HmgcrQ01237 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HmgcrQ01237 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HmgcrQ01237 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HmgcrQ01237 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HmgcrQ01237 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HmgcrQ01237 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
HmgcrQ01237 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HmgcrQ01237 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HmgcrQ01237 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HmgcrQ01237 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HmgcrQ01237 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HmgcrQ01237 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HmgcrQ01237 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HmgcrQ01237 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HmgcrQ01237 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
HmgcrQ01237 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HmgcrQ01237 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HmgcrQ01237 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HmgcrQ01237 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HmgcrQ01237 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HmgcrQ01237 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HmgcrQ01237 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
HmgcrQ01237 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HmgcrQ01237 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HmgcrQ01237 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HmgcrQ01237 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HmgcrQ01237 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HmgcrQ01237 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HmgcrQ01237 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HmgcrQ01237 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HmgcrQ01237 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
HmgcrQ01237 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
HmgcrQ01237 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
HmgcrQ01237 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
HmgcrQ01237 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
HmgcrQ01237 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
HmgcrQ01237 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HmgcrQ01237 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HmgcrQ01237 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HmgcrQ01237 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HmgcrQ01237 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HmgcrQ01237 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HmgcrQ01237 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HmgcrQ01237 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HmgcrQ01237 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HmgcrQ01237 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HmgcrQ01237 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HmgcrQ01237 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HmgcrQ01237 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
HmgcrQ01237 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HmgcrQ01237 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HmgcrQ01237 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HmgcrQ01237 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HmgcrQ01237 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
HmgcrQ01237 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HmgcrQ01237 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
HmgcrQ01237 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HmgcrQ01237 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HmgcrQ01237 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HmgcrQ01237 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HmgcrQ01237 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HmgcrQ01237 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HmgcrQ01237 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HmgcrQ01237 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HmgcrQ01237 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HmgcrQ01237 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HmgcrQ01237 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms