Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Gm43066-201ENSMUST00000199589 1260 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Grin2cQ01098 Gm45166-201ENSMUST00000209073 683 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Grin2cQ01098 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Grin2cQ01098 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Grin2cQ01098 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Grin2cQ01098 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Grin2cQ01098 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Grin2cQ01098 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Grin2cQ01098 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Grin2cQ01098 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Grin2cQ01098 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Grin2cQ01098 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Grin2cQ01098 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Grin2cQ01098 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Grin2cQ01098 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Grin2cQ01098 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Grin2cQ01098 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Grin2cQ01098 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Grin2cQ01098 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Grin2cQ01098 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Grin2cQ01098 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Grin2cQ01098 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Grin2cQ01098 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Grin2cQ01098 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Grin2cQ01098 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Grin2cQ01098 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Grin2cQ01098 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Grin2cQ01098 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Grin2cQ01098 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Grin2cQ01098 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Grin2cQ01098 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Grin2cQ01098 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Grin2cQ01098 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Grin2cQ01098 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Grin2cQ01098 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Grin2cQ01098 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Grin2cQ01098 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Grin2cQ01098 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Grin2cQ01098 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Grin2cQ01098 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Grin2cQ01098 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Grin2cQ01098 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Grin2cQ01098 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Grin2cQ01098 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Grin2cQ01098 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Grin2cQ01098 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Grin2cQ01098 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Grin2cQ01098 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Grin2cQ01098 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Grin2cQ01098 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Grin2cQ01098 Bud31-203ENSMUST00000160075 928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Grin2cQ01098 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Grin2cQ01098 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Grin2cQ01098 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Grin2cQ01098 Gm16833-202ENSMUST00000189204 672 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Grin2cQ01098 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Grin2cQ01098 AC154616.1-201ENSMUST00000226995 804 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Grin2cQ01098 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Grin2cQ01098 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Grin2cQ01098 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Grin2cQ01098 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Grin2cQ01098 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Grin2cQ01098 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Grin2cQ01098 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Grin2cQ01098 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Grin2cQ01098 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Grin2cQ01098 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Grin2cQ01098 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Grin2cQ01098 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Grin2cQ01098 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Grin2cQ01098 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Grin2cQ01098 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Grin2cQ01098 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Grin2cQ01098 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Grin2cQ01098 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Grin2cQ01098 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Grin2cQ01098 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Grin2cQ01098 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Grin2cQ01098 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Grin2cQ01098 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Grin2cQ01098 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Grin2cQ01098 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Grin2cQ01098 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Grin2cQ01098 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Grin2cQ01098 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Grin2cQ01098 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Grin2cQ01098 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Grin2cQ01098 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Grin2cQ01098 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Grin2cQ01098 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Grin2cQ01098 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Grin2cQ01098 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Grin2cQ01098 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Grin2cQ01098 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Grin2cQ01098 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Grin2cQ01098 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Grin2cQ01098 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Grin2cQ01098 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Grin2cQ01098 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Grin2cQ01098 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms