Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gjb2Q00977 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gjb2Q00977 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gjb2Q00977 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gjb2Q00977 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gjb2Q00977 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gjb2Q00977 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gjb2Q00977 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gjb2Q00977 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gjb2Q00977 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gjb2Q00977 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gjb2Q00977 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gjb2Q00977 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gjb2Q00977 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gjb2Q00977 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gjb2Q00977 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gjb2Q00977 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gjb2Q00977 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gjb2Q00977 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gjb2Q00977 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gjb2Q00977 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gjb2Q00977 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gjb2Q00977 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gjb2Q00977 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gjb2Q00977 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gjb2Q00977 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gjb2Q00977 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gjb2Q00977 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gjb2Q00977 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gjb2Q00977 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gjb2Q00977 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gjb2Q00977 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gjb2Q00977 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gjb2Q00977 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gjb2Q00977 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gjb2Q00977 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gjb2Q00977 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gjb2Q00977 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gjb2Q00977 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gjb2Q00977 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gjb2Q00977 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gjb2Q00977 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gjb2Q00977 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gjb2Q00977 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gjb2Q00977 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gjb2Q00977 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gjb2Q00977 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gjb2Q00977 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gjb2Q00977 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gjb2Q00977 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gjb2Q00977 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gjb2Q00977 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gjb2Q00977 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gjb2Q00977 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gjb2Q00977 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gjb2Q00977 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gjb2Q00977 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gjb2Q00977 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gjb2Q00977 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gjb2Q00977 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gjb2Q00977 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gjb2Q00977 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gjb2Q00977 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gjb2Q00977 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gjb2Q00977 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gjb2Q00977 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gjb2Q00977 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gjb2Q00977 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gjb2Q00977 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gjb2Q00977 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gjb2Q00977 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gjb2Q00977 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gjb2Q00977 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gjb2Q00977 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gjb2Q00977 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gjb2Q00977 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gjb2Q00977 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gjb2Q00977 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gjb2Q00977 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gjb2Q00977 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gjb2Q00977 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gjb2Q00977 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gjb2Q00977 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gjb2Q00977 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gjb2Q00977 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gjb2Q00977 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gjb2Q00977 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gjb2Q00977 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gjb2Q00977 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gjb2Q00977 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gjb2Q00977 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gjb2Q00977 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gjb2Q00977 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gjb2Q00977 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gjb2Q00977 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gjb2Q00977 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gjb2Q00977 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gjb2Q00977 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gjb2Q00977 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gjb2Q00977 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms