Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Itga4Q00651 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms