Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms