Protein–RNA interactions for Protein: P97459

Npas1, Neuronal PAS domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 594 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas1P97459 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Npas1P97459 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Npas1P97459 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Npas1P97459 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Npas1P97459 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Npas1P97459 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Npas1P97459 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Npas1P97459 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Npas1P97459 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Npas1P97459 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Npas1P97459 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Npas1P97459 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Npas1P97459 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Npas1P97459 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Npas1P97459 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Npas1P97459 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Npas1P97459 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Npas1P97459 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Npas1P97459 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Npas1P97459 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Npas1P97459 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Npas1P97459 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Npas1P97459 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Npas1P97459 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Npas1P97459 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Npas1P97459 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Npas1P97459 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Npas1P97459 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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