Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nbr1P97432 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nbr1P97432 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nbr1P97432 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nbr1P97432 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nbr1P97432 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nbr1P97432 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nbr1P97432 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Nbr1P97432 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nbr1P97432 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nbr1P97432 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nbr1P97432 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nbr1P97432 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Nbr1P97432 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nbr1P97432 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nbr1P97432 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nbr1P97432 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nbr1P97432 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nbr1P97432 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nbr1P97432 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nbr1P97432 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nbr1P97432 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nbr1P97432 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nbr1P97432 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nbr1P97432 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nbr1P97432 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nbr1P97432 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nbr1P97432 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nbr1P97432 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nbr1P97432 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nbr1P97432 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nbr1P97432 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nbr1P97432 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Nbr1P97432 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nbr1P97432 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nbr1P97432 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nbr1P97432 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nbr1P97432 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nbr1P97432 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nbr1P97432 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nbr1P97432 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nbr1P97432 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nbr1P97432 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Nbr1P97432 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nbr1P97432 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nbr1P97432 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nbr1P97432 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nbr1P97432 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nbr1P97432 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nbr1P97432 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nbr1P97432 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nbr1P97432 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nbr1P97432 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nbr1P97432 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nbr1P97432 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nbr1P97432 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nbr1P97432 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nbr1P97432 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nbr1P97432 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nbr1P97432 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nbr1P97432 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nbr1P97432 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nbr1P97432 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Nbr1P97432 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nbr1P97432 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nbr1P97432 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nbr1P97432 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nbr1P97432 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nbr1P97432 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nbr1P97432 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nbr1P97432 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nbr1P97432 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nbr1P97432 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Nbr1P97432 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Nbr1P97432 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nbr1P97432 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nbr1P97432 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nbr1P97432 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nbr1P97432 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nbr1P97432 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nbr1P97432 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nbr1P97432 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nbr1P97432 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nbr1P97432 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nbr1P97432 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nbr1P97432 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nbr1P97432 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nbr1P97432 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nbr1P97432 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nbr1P97432 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nbr1P97432 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nbr1P97432 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nbr1P97432 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nbr1P97432 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nbr1P97432 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Nbr1P97432 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nbr1P97432 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nbr1P97432 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nbr1P97432 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nbr1P97432 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms