Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Mesp1P97309 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Gm19331-201ENSMUST00000193799 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Mesp1P97309 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Mesp1P97309 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Gm5860-202ENSMUST00000151038 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Mesp1P97309 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Mesp1P97309 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Mesp1P97309 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Mesp1P97309 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Mesp1P97309 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.9 ms