Protein–RNA interactions for Protein: P80560

Ptprn2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, mousemouse

Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn2P80560 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ptprn2P80560 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ptprn2P80560 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ptprn2P80560 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ptprn2P80560 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ptprn2P80560 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ptprn2P80560 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ptprn2P80560 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ptprn2P80560 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ptprn2P80560 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ptprn2P80560 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ptprn2P80560 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ptprn2P80560 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ptprn2P80560 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ptprn2P80560 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ptprn2P80560 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ptprn2P80560 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ptprn2P80560 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ptprn2P80560 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ptprn2P80560 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ptprn2P80560 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ptprn2P80560 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ptprn2P80560 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ptprn2P80560 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ptprn2P80560 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ptprn2P80560 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ptprn2P80560 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ptprn2P80560 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ptprn2P80560 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ptprn2P80560 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ptprn2P80560 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ptprn2P80560 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ptprn2P80560 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ptprn2P80560 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ptprn2P80560 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ptprn2P80560 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ptprn2P80560 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ptprn2P80560 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ptprn2P80560 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ptprn2P80560 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ptprn2P80560 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ptprn2P80560 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ptprn2P80560 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ptprn2P80560 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ptprn2P80560 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ptprn2P80560 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ptprn2P80560 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ptprn2P80560 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ptprn2P80560 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ptprn2P80560 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ptprn2P80560 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ptprn2P80560 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ptprn2P80560 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ptprn2P80560 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ptprn2P80560 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ptprn2P80560 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ptprn2P80560 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ptprn2P80560 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ptprn2P80560 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ptprn2P80560 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ptprn2P80560 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ptprn2P80560 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ptprn2P80560 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ptprn2P80560 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ptprn2P80560 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ptprn2P80560 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ptprn2P80560 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ptprn2P80560 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ptprn2P80560 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ptprn2P80560 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ptprn2P80560 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ptprn2P80560 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ptprn2P80560 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ptprn2P80560 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ptprn2P80560 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ptprn2P80560 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ptprn2P80560 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ptprn2P80560 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ptprn2P80560 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ptprn2P80560 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ptprn2P80560 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ptprn2P80560 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ptprn2P80560 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ptprn2P80560 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ptprn2P80560 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ptprn2P80560 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ptprn2P80560 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ptprn2P80560 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ptprn2P80560 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ptprn2P80560 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ptprn2P80560 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ptprn2P80560 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ptprn2P80560 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ptprn2P80560 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ptprn2P80560 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ptprn2P80560 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ptprn2P80560 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ptprn2P80560 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ptprn2P80560 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ptprn2P80560 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms