Protein–RNA interactions for Protein: P70368

Sebox, Homeobox protein SEBOX, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeboxP70368 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SeboxP70368 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SeboxP70368 1700016D06Rik-201ENSMUST00000033906 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Nrg1-213ENSMUST00000208617 2787 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Pax6-225ENSMUST00000167211 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Bpifb9b-201ENSMUST00000088921 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Satb1-207ENSMUST00000140979 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Gm12296-201ENSMUST00000144922 3220 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Sfxn5-201ENSMUST00000045846 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SeboxP70368 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SeboxP70368 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SeboxP70368 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SeboxP70368 CT868720.1-201ENSMUST00000223069 2544 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Ppp1r12a-205ENSMUST00000219263 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Chd7-206ENSMUST00000170391 3462 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Caprin1-202ENSMUST00000111147 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Hk3-201ENSMUST00000052949 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.52□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SeboxP70368 Gm13920-201ENSMUST00000146134 1663 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SeboxP70368 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SeboxP70368 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
SeboxP70368 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SeboxP70368 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SeboxP70368 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SeboxP70368 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
SeboxP70368 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
SeboxP70368 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
SeboxP70368 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
SeboxP70368 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
SeboxP70368 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SeboxP70368 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms