Protein–RNA interactions for Protein: P70281

Sycp3, Synaptonemal complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp3P70281 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sycp3P70281 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sycp3P70281 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sycp3P70281 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sycp3P70281 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sycp3P70281 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sycp3P70281 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sycp3P70281 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sycp3P70281 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sycp3P70281 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sycp3P70281 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sycp3P70281 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sycp3P70281 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sycp3P70281 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sycp3P70281 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sycp3P70281 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sycp3P70281 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sycp3P70281 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sycp3P70281 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sycp3P70281 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sycp3P70281 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sycp3P70281 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sycp3P70281 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sycp3P70281 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sycp3P70281 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sycp3P70281 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sycp3P70281 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sycp3P70281 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sycp3P70281 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sycp3P70281 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sycp3P70281 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sycp3P70281 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sycp3P70281 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sycp3P70281 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sycp3P70281 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sycp3P70281 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sycp3P70281 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Sycp3P70281 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Sycp3P70281 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sycp3P70281 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Sycp3P70281 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sycp3P70281 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Sycp3P70281 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sycp3P70281 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sycp3P70281 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Sycp3P70281 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sycp3P70281 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sycp3P70281 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Sycp3P70281 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sycp3P70281 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sycp3P70281 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sycp3P70281 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sycp3P70281 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sycp3P70281 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sycp3P70281 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sycp3P70281 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sycp3P70281 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sycp3P70281 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sycp3P70281 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sycp3P70281 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sycp3P70281 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sycp3P70281 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sycp3P70281 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sycp3P70281 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sycp3P70281 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sycp3P70281 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sycp3P70281 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sycp3P70281 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sycp3P70281 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sycp3P70281 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sycp3P70281 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sycp3P70281 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sycp3P70281 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sycp3P70281 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sycp3P70281 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sycp3P70281 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sycp3P70281 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sycp3P70281 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sycp3P70281 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Sycp3P70281 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sycp3P70281 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sycp3P70281 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Sycp3P70281 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Sycp3P70281 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sycp3P70281 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sycp3P70281 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sycp3P70281 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sycp3P70281 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sycp3P70281 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sycp3P70281 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sycp3P70281 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sycp3P70281 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sycp3P70281 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sycp3P70281 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sycp3P70281 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sycp3P70281 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sycp3P70281 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sycp3P70281 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sycp3P70281 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sycp3P70281 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms