Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SbdsP70122 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
SbdsP70122 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SbdsP70122 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SbdsP70122 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SbdsP70122 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
SbdsP70122 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SbdsP70122 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SbdsP70122 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SbdsP70122 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SbdsP70122 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SbdsP70122 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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