Protein–RNA interactions for Protein: P62823

Rab3c, Ras-related protein Rab-3C, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3cP62823 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms