Protein–RNA interactions for Protein: P62821

Rab1A, Ras-related protein Rab-1A, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab1AP62821 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab1AP62821 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab1AP62821 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab1AP62821 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab1AP62821 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab1AP62821 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab1AP62821 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab1AP62821 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab1AP62821 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab1AP62821 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab1AP62821 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab1AP62821 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab1AP62821 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab1AP62821 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab1AP62821 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab1AP62821 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab1AP62821 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab1AP62821 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab1AP62821 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab1AP62821 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab1AP62821 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab1AP62821 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab1AP62821 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab1AP62821 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab1AP62821 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab1AP62821 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab1AP62821 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab1AP62821 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab1AP62821 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab1AP62821 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab1AP62821 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab1AP62821 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab1AP62821 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab1AP62821 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab1AP62821 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab1AP62821 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab1AP62821 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab1AP62821 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab1AP62821 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab1AP62821 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab1AP62821 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab1AP62821 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab1AP62821 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab1AP62821 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab1AP62821 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab1AP62821 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab1AP62821 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab1AP62821 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab1AP62821 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab1AP62821 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab1AP62821 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab1AP62821 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab1AP62821 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab1AP62821 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab1AP62821 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab1AP62821 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab1AP62821 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab1AP62821 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab1AP62821 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab1AP62821 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab1AP62821 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab1AP62821 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab1AP62821 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab1AP62821 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab1AP62821 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab1AP62821 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab1AP62821 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab1AP62821 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab1AP62821 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab1AP62821 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab1AP62821 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab1AP62821 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab1AP62821 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab1AP62821 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab1AP62821 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab1AP62821 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab1AP62821 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab1AP62821 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab1AP62821 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab1AP62821 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab1AP62821 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab1AP62821 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab1AP62821 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab1AP62821 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab1AP62821 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab1AP62821 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab1AP62821 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab1AP62821 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab1AP62821 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab1AP62821 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab1AP62821 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab1AP62821 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab1AP62821 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab1AP62821 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab1AP62821 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab1AP62821 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Rab1AP62821 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rab1AP62821 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rab1AP62821 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rab1AP62821 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms