Protein–RNA interactions for Protein: P62737

Acta2, Actin, aortic smooth muscle, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta2P62737 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Acta2P62737 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Acta2P62737 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Acta2P62737 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Acta2P62737 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Acta2P62737 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Acta2P62737 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Acta2P62737 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Acta2P62737 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Acta2P62737 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Acta2P62737 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Acta2P62737 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Acta2P62737 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Acta2P62737 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Acta2P62737 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Acta2P62737 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Acta2P62737 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Acta2P62737 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Acta2P62737 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Acta2P62737 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Acta2P62737 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Acta2P62737 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Acta2P62737 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Acta2P62737 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Acta2P62737 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Acta2P62737 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Acta2P62737 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Acta2P62737 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Acta2P62737 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Acta2P62737 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Acta2P62737 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Acta2P62737 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Acta2P62737 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Acta2P62737 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Acta2P62737 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Acta2P62737 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Acta2P62737 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Acta2P62737 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Acta2P62737 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Acta2P62737 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Acta2P62737 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Acta2P62737 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Acta2P62737 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Acta2P62737 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Acta2P62737 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Acta2P62737 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Acta2P62737 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Acta2P62737 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Acta2P62737 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Acta2P62737 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Acta2P62737 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Acta2P62737 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Acta2P62737 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Acta2P62737 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Acta2P62737 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Acta2P62737 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Acta2P62737 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Acta2P62737 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Acta2P62737 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Acta2P62737 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Acta2P62737 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Acta2P62737 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Acta2P62737 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Acta2P62737 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Acta2P62737 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Acta2P62737 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Acta2P62737 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Acta2P62737 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Acta2P62737 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Acta2P62737 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Acta2P62737 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Acta2P62737 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Acta2P62737 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Acta2P62737 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Acta2P62737 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Acta2P62737 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Acta2P62737 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Acta2P62737 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Acta2P62737 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Acta2P62737 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Acta2P62737 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Acta2P62737 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Acta2P62737 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Acta2P62737 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Acta2P62737 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Acta2P62737 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Acta2P62737 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Acta2P62737 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Acta2P62737 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Acta2P62737 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Acta2P62737 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Acta2P62737 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Acta2P62737 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Acta2P62737 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Acta2P62737 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Acta2P62737 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Acta2P62737 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Acta2P62737 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Acta2P62737 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Acta2P62737 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms