Protein–RNA interactions for Protein: P60898

Polr2i, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2iP60898 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Polr2iP60898 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Polr2iP60898 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Polr2iP60898 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Polr2iP60898 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Polr2iP60898 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms