Protein–RNA interactions for Protein: P56213

Gfer, FAD-linked sulfhydryl oxidase ALR, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GferP56213 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
GferP56213 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
GferP56213 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
GferP56213 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
GferP56213 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
GferP56213 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
GferP56213 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
GferP56213 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
GferP56213 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
GferP56213 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
GferP56213 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
GferP56213 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
GferP56213 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
GferP56213 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
GferP56213 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
GferP56213 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
GferP56213 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
GferP56213 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
GferP56213 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
GferP56213 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
GferP56213 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
GferP56213 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
GferP56213 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
GferP56213 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
GferP56213 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
GferP56213 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
GferP56213 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
GferP56213 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
GferP56213 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
GferP56213 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
GferP56213 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
GferP56213 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
GferP56213 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
GferP56213 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
GferP56213 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
GferP56213 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
GferP56213 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
GferP56213 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
GferP56213 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
GferP56213 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
GferP56213 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
GferP56213 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
GferP56213 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
GferP56213 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
GferP56213 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
GferP56213 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
GferP56213 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
GferP56213 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
GferP56213 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
GferP56213 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
GferP56213 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
GferP56213 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
GferP56213 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
GferP56213 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
GferP56213 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
GferP56213 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
GferP56213 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
GferP56213 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
GferP56213 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
GferP56213 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
GferP56213 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
GferP56213 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
GferP56213 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
GferP56213 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
GferP56213 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
GferP56213 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
GferP56213 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
GferP56213 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
GferP56213 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
GferP56213 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
GferP56213 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
GferP56213 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
GferP56213 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
GferP56213 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
GferP56213 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
GferP56213 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
GferP56213 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
GferP56213 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
GferP56213 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
GferP56213 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
GferP56213 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
GferP56213 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
GferP56213 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
GferP56213 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
GferP56213 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
GferP56213 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
GferP56213 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
GferP56213 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
GferP56213 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
GferP56213 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
GferP56213 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
GferP56213 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
GferP56213 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
GferP56213 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
GferP56213 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
GferP56213 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
GferP56213 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
GferP56213 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
GferP56213 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
GferP56213 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms