Protein–RNA interactions for Protein: P52950

Dbx1, Homeobox protein DBX1, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dbx1P52950 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dbx1P52950 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dbx1P52950 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dbx1P52950 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dbx1P52950 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dbx1P52950 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dbx1P52950 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dbx1P52950 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dbx1P52950 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dbx1P52950 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dbx1P52950 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dbx1P52950 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dbx1P52950 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Dbx1P52950 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Dbx1P52950 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Dbx1P52950 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dbx1P52950 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dbx1P52950 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dbx1P52950 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dbx1P52950 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dbx1P52950 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dbx1P52950 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dbx1P52950 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Dbx1P52950 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Dbx1P52950 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Dbx1P52950 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Dbx1P52950 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dbx1P52950 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dbx1P52950 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dbx1P52950 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Dbx1P52950 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dbx1P52950 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dbx1P52950 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dbx1P52950 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dbx1P52950 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dbx1P52950 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dbx1P52950 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Dbx1P52950 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dbx1P52950 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dbx1P52950 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dbx1P52950 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dbx1P52950 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dbx1P52950 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dbx1P52950 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dbx1P52950 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dbx1P52950 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dbx1P52950 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dbx1P52950 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dbx1P52950 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dbx1P52950 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dbx1P52950 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dbx1P52950 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dbx1P52950 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dbx1P52950 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dbx1P52950 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dbx1P52950 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dbx1P52950 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dbx1P52950 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dbx1P52950 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dbx1P52950 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dbx1P52950 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dbx1P52950 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dbx1P52950 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dbx1P52950 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dbx1P52950 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dbx1P52950 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dbx1P52950 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dbx1P52950 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dbx1P52950 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dbx1P52950 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dbx1P52950 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Dbx1P52950 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dbx1P52950 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dbx1P52950 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dbx1P52950 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dbx1P52950 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dbx1P52950 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dbx1P52950 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Dbx1P52950 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dbx1P52950 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dbx1P52950 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dbx1P52950 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dbx1P52950 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Dbx1P52950 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dbx1P52950 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dbx1P52950 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Dbx1P52950 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dbx1P52950 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dbx1P52950 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dbx1P52950 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dbx1P52950 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dbx1P52950 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dbx1P52950 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dbx1P52950 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dbx1P52950 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dbx1P52950 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dbx1P52950 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Dbx1P52950 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Dbx1P52950 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Dbx1P52950 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms