Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PtpreP49446 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Gm29644-201ENSMUST00000189003 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PtpreP49446 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Gm25509-201ENSMUST00000116985 106 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Atp6v1c2-207ENSMUST00000156727 1279 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
PtpreP49446 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PtpreP49446 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PtpreP49446 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
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PtpreP49446 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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PtpreP49446 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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PtpreP49446 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
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PtpreP49446 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Tbata-209ENSMUST00000148181 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PtpreP49446 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PtpreP49446 AC140209.1-201ENSMUST00000227875 284 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
PtpreP49446 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Il2-201ENSMUST00000029275 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PtpreP49446 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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