Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
VdrP48281 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
VdrP48281 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
VdrP48281 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
VdrP48281 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
VdrP48281 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
VdrP48281 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
VdrP48281 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
VdrP48281 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
VdrP48281 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
VdrP48281 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
VdrP48281 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
VdrP48281 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
VdrP48281 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
VdrP48281 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
VdrP48281 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
VdrP48281 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
VdrP48281 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
VdrP48281 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
VdrP48281 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
VdrP48281 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
VdrP48281 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
VdrP48281 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
VdrP48281 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
VdrP48281 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
VdrP48281 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
VdrP48281 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
VdrP48281 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
VdrP48281 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
VdrP48281 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
VdrP48281 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
VdrP48281 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
VdrP48281 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
VdrP48281 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
VdrP48281 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
VdrP48281 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
VdrP48281 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
VdrP48281 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
VdrP48281 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
VdrP48281 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
VdrP48281 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
VdrP48281 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
VdrP48281 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
VdrP48281 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
VdrP48281 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
VdrP48281 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
VdrP48281 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
VdrP48281 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
VdrP48281 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
VdrP48281 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
VdrP48281 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
VdrP48281 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
VdrP48281 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
VdrP48281 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
VdrP48281 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
VdrP48281 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
VdrP48281 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
VdrP48281 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
VdrP48281 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
VdrP48281 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
VdrP48281 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
VdrP48281 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
VdrP48281 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
VdrP48281 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
VdrP48281 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
VdrP48281 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
VdrP48281 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
VdrP48281 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
VdrP48281 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
VdrP48281 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
VdrP48281 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
VdrP48281 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
VdrP48281 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
VdrP48281 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VdrP48281 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VdrP48281 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VdrP48281 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
VdrP48281 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VdrP48281 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VdrP48281 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
VdrP48281 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VdrP48281 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VdrP48281 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VdrP48281 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
VdrP48281 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VdrP48281 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VdrP48281 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VdrP48281 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VdrP48281 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VdrP48281 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VdrP48281 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VdrP48281 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
VdrP48281 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
VdrP48281 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VdrP48281 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
VdrP48281 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
VdrP48281 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
VdrP48281 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
VdrP48281 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VdrP48281 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms