Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms