Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Rpl28P41105 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms