Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TtlP38585 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TtlP38585 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TtlP38585 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TtlP38585 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TtlP38585 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TtlP38585 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TtlP38585 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TtlP38585 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TtlP38585 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TtlP38585 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TtlP38585 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TtlP38585 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TtlP38585 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TtlP38585 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TtlP38585 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TtlP38585 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TtlP38585 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
TtlP38585 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TtlP38585 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TtlP38585 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TtlP38585 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
TtlP38585 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
TtlP38585 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TtlP38585 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TtlP38585 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TtlP38585 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
TtlP38585 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
TtlP38585 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
TtlP38585 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TtlP38585 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
TtlP38585 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
TtlP38585 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
TtlP38585 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
TtlP38585 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
TtlP38585 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TtlP38585 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
TtlP38585 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
TtlP38585 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TtlP38585 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
TtlP38585 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TtlP38585 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TtlP38585 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
TtlP38585 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
TtlP38585 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
TtlP38585 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TtlP38585 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TtlP38585 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
TtlP38585 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
TtlP38585 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TtlP38585 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TtlP38585 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TtlP38585 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TtlP38585 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
TtlP38585 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
TtlP38585 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TtlP38585 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TtlP38585 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TtlP38585 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TtlP38585 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TtlP38585 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
TtlP38585 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TtlP38585 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TtlP38585 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TtlP38585 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TtlP38585 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TtlP38585 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TtlP38585 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TtlP38585 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
TtlP38585 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
TtlP38585 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
TtlP38585 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
TtlP38585 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC12□□□□□ -0.49
TtlP38585 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC12□□□□□ -0.49
TtlP38585 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
TtlP38585 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TtlP38585 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TtlP38585 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
TtlP38585 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TtlP38585 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TtlP38585 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
TtlP38585 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TtlP38585 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
TtlP38585 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TtlP38585 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TtlP38585 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
TtlP38585 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TtlP38585 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TtlP38585 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TtlP38585 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TtlP38585 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TtlP38585 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TtlP38585 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TtlP38585 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TtlP38585 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TtlP38585 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TtlP38585 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
TtlP38585 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TtlP38585 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TtlP38585 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.6 ms