Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lig1P37913 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lig1P37913 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lig1P37913 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lig1P37913 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lig1P37913 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lig1P37913 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lig1P37913 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Lig1P37913 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lig1P37913 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lig1P37913 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms