Protein–RNA interactions for Protein: P35278

Rab5c, Ras-related protein Rab-5C, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5cP35278 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.6 ms