Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RxrgP28705 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RxrgP28705 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RxrgP28705 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RxrgP28705 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
RxrgP28705 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RxrgP28705 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RxrgP28705 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RxrgP28705 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RxrgP28705 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RxrgP28705 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RxrgP28705 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
RxrgP28705 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RxrgP28705 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RxrgP28705 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RxrgP28705 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RxrgP28705 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RxrgP28705 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
RxrgP28705 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
RxrgP28705 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
RxrgP28705 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
RxrgP28705 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
RxrgP28705 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
RxrgP28705 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
RxrgP28705 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
RxrgP28705 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
RxrgP28705 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
RxrgP28705 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
RxrgP28705 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
RxrgP28705 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
RxrgP28705 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
RxrgP28705 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
RxrgP28705 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
RxrgP28705 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
RxrgP28705 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
RxrgP28705 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
RxrgP28705 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
RxrgP28705 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
RxrgP28705 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
RxrgP28705 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
RxrgP28705 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
RxrgP28705 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
RxrgP28705 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
RxrgP28705 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
RxrgP28705 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
RxrgP28705 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RxrgP28705 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
RxrgP28705 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RxrgP28705 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
RxrgP28705 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RxrgP28705 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RxrgP28705 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms