Protein–RNA interactions for Protein: P28663

Napb, Beta-soluble NSF attachment protein, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NapbP28663 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NapbP28663 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NapbP28663 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NapbP28663 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
NapbP28663 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NapbP28663 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NapbP28663 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NapbP28663 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NapbP28663 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
NapbP28663 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NapbP28663 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NapbP28663 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
NapbP28663 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NapbP28663 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NapbP28663 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NapbP28663 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NapbP28663 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NapbP28663 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NapbP28663 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NapbP28663 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NapbP28663 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NapbP28663 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NapbP28663 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NapbP28663 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NapbP28663 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NapbP28663 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NapbP28663 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NapbP28663 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NapbP28663 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NapbP28663 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NapbP28663 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NapbP28663 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NapbP28663 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NapbP28663 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NapbP28663 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NapbP28663 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NapbP28663 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NapbP28663 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NapbP28663 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NapbP28663 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NapbP28663 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NapbP28663 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
NapbP28663 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NapbP28663 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NapbP28663 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
NapbP28663 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NapbP28663 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
NapbP28663 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NapbP28663 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NapbP28663 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NapbP28663 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NapbP28663 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NapbP28663 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NapbP28663 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NapbP28663 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NapbP28663 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NapbP28663 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NapbP28663 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NapbP28663 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
NapbP28663 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NapbP28663 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NapbP28663 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NapbP28663 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NapbP28663 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NapbP28663 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NapbP28663 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NapbP28663 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NapbP28663 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NapbP28663 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NapbP28663 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NapbP28663 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NapbP28663 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NapbP28663 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NapbP28663 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NapbP28663 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NapbP28663 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NapbP28663 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NapbP28663 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NapbP28663 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
NapbP28663 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NapbP28663 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NapbP28663 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NapbP28663 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NapbP28663 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NapbP28663 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NapbP28663 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
NapbP28663 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NapbP28663 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NapbP28663 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NapbP28663 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NapbP28663 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NapbP28663 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NapbP28663 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NapbP28663 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NapbP28663 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NapbP28663 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NapbP28663 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NapbP28663 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NapbP28663 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NapbP28663 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms