Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
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Hoxd10P28359 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxd10P28359 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxd10P28359 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Hoxd10P28359 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxd10P28359 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Hoxd10P28359 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Hoxd10P28359 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd10P28359 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd10P28359 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd10P28359 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd10P28359 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd10P28359 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd10P28359 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd10P28359 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Hoxd10P28359 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Hoxd10P28359 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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