Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Pde6aP27664 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
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Pde6aP27664 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Pde6aP27664 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Pde6aP27664 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Pde6aP27664 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Pde6aP27664 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Pde6aP27664 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Pde6aP27664 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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