Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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PdgfraP26618 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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PdgfraP26618 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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PdgfraP26618 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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PdgfraP26618 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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PdgfraP26618 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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