Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
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Ggta1P23336 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Ggta1P23336 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Ggta1P23336 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Ggta1P23336 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Ggta1P23336 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Ggta1P23336 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Ggta1P23336 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Ggta1P23336 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Ggta1P23336 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Ggta1P23336 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Ggta1P23336 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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