Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms