Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RarbP22605 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RarbP22605 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RarbP22605 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RarbP22605 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RarbP22605 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RarbP22605 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RarbP22605 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RarbP22605 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RarbP22605 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RarbP22605 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RarbP22605 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RarbP22605 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RarbP22605 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RarbP22605 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RarbP22605 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RarbP22605 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RarbP22605 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RarbP22605 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RarbP22605 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RarbP22605 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RarbP22605 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RarbP22605 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RarbP22605 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
RarbP22605 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RarbP22605 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RarbP22605 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RarbP22605 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RarbP22605 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RarbP22605 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
RarbP22605 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RarbP22605 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RarbP22605 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RarbP22605 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RarbP22605 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RarbP22605 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RarbP22605 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
RarbP22605 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RarbP22605 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
RarbP22605 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
RarbP22605 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
RarbP22605 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RarbP22605 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RarbP22605 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
RarbP22605 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RarbP22605 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RarbP22605 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
RarbP22605 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RarbP22605 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RarbP22605 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RarbP22605 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RarbP22605 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RarbP22605 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RarbP22605 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RarbP22605 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RarbP22605 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RarbP22605 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RarbP22605 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RarbP22605 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
RarbP22605 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RarbP22605 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RarbP22605 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RarbP22605 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RarbP22605 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RarbP22605 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
RarbP22605 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RarbP22605 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RarbP22605 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RarbP22605 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RarbP22605 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RarbP22605 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RarbP22605 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RarbP22605 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RarbP22605 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
RarbP22605 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RarbP22605 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RarbP22605 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RarbP22605 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RarbP22605 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RarbP22605 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RarbP22605 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RarbP22605 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
RarbP22605 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
RarbP22605 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RarbP22605 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RarbP22605 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RarbP22605 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RarbP22605 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RarbP22605 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
RarbP22605 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
RarbP22605 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RarbP22605 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RarbP22605 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RarbP22605 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RarbP22605 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RarbP22605 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RarbP22605 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RarbP22605 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RarbP22605 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RarbP22605 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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