Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms