Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
P20040 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
P20040 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P20040 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P20040 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P20040 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
P20040 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
P20040 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P20040 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P20040 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P20040 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P20040 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
P20040 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
P20040 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
P20040 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P20040 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
P20040 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P20040 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P20040 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P20040 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P20040 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P20040 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P20040 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
P20040 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
P20040 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P20040 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P20040 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P20040 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
P20040 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P20040 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P20040 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
P20040 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
P20040 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
P20040 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
P20040 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P20040 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
P20040 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P20040 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P20040 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
P20040 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P20040 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P20040 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P20040 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P20040 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
P20040 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
P20040 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P20040 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
P20040 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
P20040 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
P20040 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
P20040 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
P20040 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
P20040 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
P20040 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
P20040 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P20040 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P20040 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
P20040 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
P20040 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P20040 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
P20040 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P20040 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P20040 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
P20040 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
P20040 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
P20040 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
P20040 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
P20040 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
P20040 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
P20040 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
P20040 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
P20040 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
P20040 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
P20040 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
P20040 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
P20040 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
P20040 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
P20040 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
P20040 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
P20040 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
P20040 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
P20040 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
P20040 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
P20040 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
P20040 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
P20040 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
P20040 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
P20040 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
P20040 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
P20040 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
P20040 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
P20040 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
P20040 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
P20040 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
P20040 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
P20040 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
P20040 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
P20040 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
P20040 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
P20040 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.62
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