Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18530 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
P18530 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18530 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18530 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18530 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18530 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18530 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18530 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18530 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18530 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18530 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18530 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18530 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18530 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
P18530 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18530 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18530 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
P18530 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18530 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18530 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18530 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18530 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18530 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18530 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18530 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18530 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18530 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18530 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
P18530 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18530 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18530 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
P18530 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18530 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
P18530 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18530 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18530 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
P18530 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18530 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18530 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18530 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18530 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18530 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18530 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18530 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18530 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18530 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18530 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18530 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18530 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18530 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18530 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18530 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18530 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18530 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18530 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18530 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18530 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P18530 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
P18530 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
P18530 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P18530 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
P18530 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P18530 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P18530 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P18530 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P18530 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P18530 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P18530 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P18530 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
P18530 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
P18530 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
P18530 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
P18530 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
P18530 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P18530 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
P18530 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
P18530 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
P18530 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
P18530 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
P18530 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
P18530 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P18530 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P18530 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P18530 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P18530 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P18530 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P18530 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P18530 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P18530 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P18530 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P18530 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
P18530 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
P18530 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
P18530 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P18530 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P18530 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P18530 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P18530 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P18530 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms